Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms