Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms