Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms