Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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