Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxraP28700 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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