Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BgnP28653 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BgnP28653 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BgnP28653 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BgnP28653 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BgnP28653 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BgnP28653 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BgnP28653 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BgnP28653 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BgnP28653 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BgnP28653 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BgnP28653 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
BgnP28653 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BgnP28653 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BgnP28653 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BgnP28653 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BgnP28653 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BgnP28653 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BgnP28653 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
BgnP28653 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
BgnP28653 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms