Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms