Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Hist1h1d-201ENSMUST00000045301 7425 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa2P28309 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa2P28309 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa2P28309 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms