Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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