Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gja1P23242 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms