Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
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P18530 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
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P18530 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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P18530 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18530 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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