Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18524 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18524 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18524 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18524 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18524 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18524 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18524 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18524 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18524 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18524 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18524 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P18524 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18524 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18524 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18524 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18524 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18524 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18524 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18524 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P18524 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18524 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18524 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18524 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18524 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms