Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Defa-rs1P17533 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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