Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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