Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm38250-202ENSMUST00000195108 462 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irf1P15314 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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