Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm43965-201ENSMUST00000203779 789 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm34397-201ENSMUST00000213192 708 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
DmdP11531 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm33016-201ENSMUST00000221224 677 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms