Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms