Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-Eb1P04230 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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