Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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