Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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