Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms