Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms