Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Pkd2O35245 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkd2O35245 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Pkd2O35245 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms