Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms