Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp870J3QMA4 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms