Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms