Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r67G5E8C1 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r67G5E8C1 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms