Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms