Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms