Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Usp9yF8VPU6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Usp9yF8VPU6 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Usp9yF8VPU6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Usp9yF8VPU6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Usp9yF8VPU6 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Usp9yF8VPU6 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Usp9yF8VPU6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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