Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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H2-M1F7CXU4 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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