Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rarres1F6ZIS7 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms