Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Klf6-201ENSMUST00000000080 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 4933427D14Rik-202ENSMUST00000108506 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Olfr806-203ENSMUST00000215142 3108 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Spag9-201ENSMUST00000024979 6756 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Ank3-237ENSMUST00000183074 4948 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Cd4-201ENSMUST00000024044 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Bhlhe40-201ENSMUST00000032194 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Nmnat2-201ENSMUST00000043313 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 L3mbtl2-201ENSMUST00000023029 3487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Slc22a21-201ENSMUST00000076493 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 6530403H02Rik-202ENSMUST00000182124 3191 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Pde4b-205ENSMUST00000106904 2430 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Top3a-202ENSMUST00000102668 3542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm12116-201ENSMUST00000131851 2770 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm19589-201ENSMUST00000189394 2623 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Pdk4-201ENSMUST00000019721 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm14524-201ENSMUST00000121066 683 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gja10-202ENSMUST00000219644 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Grip1-213ENSMUST00000147454 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 D030018L15Rik-203ENSMUST00000140253 2902 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Nrxn3-203ENSMUST00000110133 2699 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Gm26668-201ENSMUST00000181125 3635 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Rph3a-204ENSMUST00000202406 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Cdc7-202ENSMUST00000076467 2785 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20538F6Z9R1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms