Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms