Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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