Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc163A2AGD7 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms