Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms