Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms