Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms