Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Cldn13Q9Z0S4 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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