Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psma1Q9R1P4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms