Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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