Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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