Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Chrac1Q9JKP8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms