Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn2Q9ER65 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms