Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC61

Pmpca, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcaQ9DC61 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PmpcaQ9DC61 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PmpcaQ9DC61 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PmpcaQ9DC61 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PmpcaQ9DC61 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PmpcaQ9DC61 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PmpcaQ9DC61 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PmpcaQ9DC61 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PmpcaQ9DC61 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PmpcaQ9DC61 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PmpcaQ9DC61 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PmpcaQ9DC61 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PmpcaQ9DC61 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmpcaQ9DC61 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmpcaQ9DC61 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmpcaQ9DC61 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms