Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tm9sf1Q9DBU0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tm9sf1Q9DBU0 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tm9sf1Q9DBU0 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms