Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Cldn22Q9D7U6 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Cldn22Q9D7U6 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
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Cldn22Q9D7U6 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Cldn22Q9D7U6 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Cldn22Q9D7U6 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Cldn22Q9D7U6 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Cldn22Q9D7U6 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Cldn22Q9D7U6 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Cldn22Q9D7U6 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn22Q9D7U6 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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