Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms