Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms